警惕的需求：新颖的变体和疫苗突破

一年多以前，世界卫生组织正式宣布Covid-19是一个大流行。1宣布这一消息后十二个月，我们目睹了FDA紧急使用授权发布两种新型RNA疫苗和一种腺病毒载体疫苗。2–4这引发了一项疫苗接种工作，截至2021年5月20日，美国服用了超过2.75亿剂剂量的疫苗。5

疫苗接种率成功受到COVID-19疫苗功效的增强，导致CDC放松了掩模指导6并朝着重新开放的状态迈进。但是，考虑到突破性感染的可能性（完全疫苗接种的人仍然会签​​约SARS-COV-2），重要的是要记住，疫苗不是银弹，仍然需要勤奋。

例行筛查后，洛克菲勒大学最近在洛克菲勒大学发现了​​两种突破性感染。在最近的出版物中7研究人员使用靶向的RNA-seq面板对这些病例进行了更深入的研究，并检查了潜在的临床意义变体。

警惕确定了突破

洛克菲勒大学（Rockefeller University）于2020年秋天开始对所有员工和学生进行基于唾液的SARS-COV-2 QPCR测试。今年早些时候，他们监视了完成现代或辉瑞式疫苗疫苗课程的417名员工（定义为已定义为现代或辉瑞公司）的测试。在测试前至少两周接受第二剂）和1,491名未接种剂量的人。

通过这项筛查，洛克菲勒大学确定了两个对SARS-COV-2呈阳性的症状性个体。两人都没有任何严重的共同危险因素。患者1，一名51岁的妇女接受了现代疫苗；当患者2（65岁的妇女）接受辉瑞生命疫苗时。

鉴于这些不寻常的历史，研究人员选择使用使用该患者对两名患者进行靶向RNA测序雷竞技raybet安捷伦监控CD PAN人冠状病毒面板。8该面板包括针对SARS-COV-2的探针，还针对所有人类冠状病毒。

PAN人冠状病毒小组是由伦敦大学学院病原基因组学部主任朱迪思·布鲁尔（Judith Breuer）教授朱迪思·布鲁尔（Judith Breuer）教授和COVID-19 Genomics UK Consortium的成员设计的。有关此面板的更多信息以及在我们的其中一个中可以找到在病原体基因组中使用靶向NG的好处较早的文章。

打破突破

研究人员使用Sunelect CD PAN人冠状病毒面板确定了具有潜在临床意义的多个突变。两名患者携带具有D614G突变的变体，但只有患者1具有带有E484K突变的变体，可预见地显示出对中和抗体的抗性。9,10通过对患者1的变异的进一步分析，研究人员能够确定患者1中发现的变体与B.1.526（纽约）和B.1.1.7（英国）相关的变体有关。。

警惕的需求：新颖的变体和疫苗突破

确保回应

为了证明这是真正的突破，而不是对疫苗的反应，研究人员使用了假型中和测定法。50％中和测试滴度（NT50感染后1.3个月，接种疫苗的人和未接种疫苗的人的疫苗接种者明显更高（NT50在感染后6.2个月时，分别= 451和401）比未接种疫苗的人（NT）50= 78）。但是，在患者1疫苗接种和感染后观察到的极高的中和抗体滴度（NT）50= 3,209）与疫苗诱导的抗体反应一致。

鉴于E484K突变体赋予的先前观察到的抗体耐药性和与纽约变体的相似性，9,10名研究人员询问患者1的抗体是否能够识别这些变体。nt50野生型，E484K变体和纽约变体病毒之间的值并没有显着变化，这表明虽然疫苗反应足以识别已测试的变体，但不足以防止随后的感染。

讨论

展望未来，确定能够逃避疫苗保护的SARS-COV-2变体至关重要，以便我们可以监视它们的传播并有可能产生针对它们的疫苗。尽管不受欢迎的新闻，作者指出，这些发现并没有减少美国正在进行的疫苗接种工作的重要性。

罗伯特·B·达内尔（Robert B. Darnell，Ph.D。）说：“鉴于该病毒表现出有关变异的临床发展的能力，因此持续不断识别它们以减轻疾病的传播和相关的发病率。”洛克菲勒大学海尔布伦教授兼高级医师。

这些发现，尤其是根据最近修订的CDC蒙版指南，6随着我们继续浏览大流行，并努力克服它时，强调了警惕的需求。


参考：

  1. WHO总监将在2020年3月11日至2020年3月11日的媒体简报上发表开幕词，https://www.who.int/director-general/speeches/detail/detail/who-director-director-generato-general-general-s-openeral-s-openser-s-open--remarks-aramarks-at-at--at-------------媒体上的媒体训练19-2020年3月11日（2021年5月25日访问）。
  2. 专员办公室。Pfizer-Biontech Covid-19疫苗https://www.fda.gov/emmergency-preparedness-and-response/coronavirus-disease-2019-covid-19/pfizer-biontech-covid-19-vaccine（2021年5月25日访问）。
  3. 专员办公室。Moderna Covid-19疫苗https://www.fda.gov/emmergency-preparedness-and-response/coronavirus-disease-2019-covid-19/moderna-covid-19-vaccine（2021年5月25日访问）。
  4. 专员办公室。Janssen Covid-19疫苗https://www.fda.gov/emmergency-preparedness-and-response/coronavirus-disease-2019-covid-19/janssen-covid-19-vaccine（2021年5月25日访问）。
  5. CDC。COVID数据跟踪器https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/（2021年5月25日访问）。
  6. CDC。COVID-19和您的健康https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/prevent-getting-sick/cloth-face-cover-cover-guidance.html（2021年5月25日访问）。
  7. Hacisuleyman，E。;Hale，C。；塞托，Y。；N. E。Blachere;Bergh，M。；Conlon，E。G。；Schaefer-Babajew，D.J。;Dasilva，J。；Muecksch，f。;Gaebler，c。; Lifton, R.; Nussenzweig, M. C.; Hatziioannou, T.; Bieniasz, P. D.; Darnell, R. B. Vaccine Breakthrough Infections with SARS-CoV-2 Variants. N. Engl. J. Med. 2021, No. NEJMoa2105000.https://doi.org/10.1056/nejmoa2105000。
  8. 雷竞技raybetAgilent尚未在此面板上进行验证和验证。仅用于研究。不用于诊断过程。
  9. Wang，Z。;Schmidt，F。;Weisblum，Y。Muecksch，f。;Barnes，C.O。;Finkin，s。;Schaefer-Babajew，d。;Cipolla，M。；Gaebler，c。;Lieberman，J。A。； Oliveira, T. Y.; Yang, Z.; Abernathy, M. E.; Huey-Tubman, K. E.; Hurley, A.; Turroja, M.; West, K. A.; Gordon, K.; Millard, K. G.; Ramos, V.; Da Silva, J.; Xu, J.; Colbert, R. A.; Patel, R.; Dizon, J.; Unson-O'Brien, C.; Shimeliovich, I.; Gazumyan, A.; Caskey, M.; Bjorkman, P. J.; Casellas, R.; Hatziioannou, T.; Bieniasz, P. D.; Nussenzweig, M. C. MRNA Vaccine-Elicited Antibodies to SARS-CoV-2 and Circulating Variants. Nature2021，592（7855），616–622。
  10. Weisblum，Y。Schmidt，F。;张，f。;Dasilva，J。；Poston，d。;Lorenzi，J.C。;Muecksch，f。;Rutkowska，M。；H.-H。Hoffmann;Michailidis，E。; Gaebler, C.; Agudelo, M.; Cho, A.; Wang, Z.; Gazumyan, A.; Cipolla, M.; Luchsinger, L.; Hillyer, C. D.; Caskey, M.; Robbiani, D. F.; Rice, C. M.; Nussenzweig, M. C.; Hatziioannou, T.; Bieniasz, P. D. Escape from Neutralizing Antibodies by SARS-CoV-2 Spike Protein Variants. Elife2020，9。https://doi.org/10.7554/elife.61312。