RIN不计算或NA对总RNA样本2100年安捷伦生物分析仪软件专家雷竞技raybet

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问题:

RIN不是显示在软件或显示NA。如果RIN NA,样品将在红色和标记错误4501将提供一个描述如意想不到的信号……。

步骤:

检查化验被选中。RIN身上只会计算总RNA分析是否选中。RIN不会mRNA分析计算。如果选择了错误的分析类型,准备一个新的芯片和重新运行样本选择合适的总RNA分析。
检查标记和核糖体山峰已经正确分配。为此点击数据在上下文菜单中,选择的样本RIN没有计算。然后选择峰值表选项卡。指定为峰值较低的标记有一个黑色三角形上面。打开和关闭的分析可以帮助判断正确的峰被认为是较低的标志(图1)。可以指定一个不同的峰值较低的标志,悬停鼠标顶部的高峰,右击并选择手动设置较低的标志。检查什么山峰被指定为核糖体山峰选择片段表选项卡(图2)。如果它看起来像他们没有正确地分配,请审查的第67页维护和故障诊断指南可能的原因。寻求帮助检查作业高峰,请联系你的雷竞技raybet安捷伦支持代表。

图1所示。如何检查下标记作业

图2。如何检查核糖体亚基的任务吗

检查是否有错误选项卡呈现下一个片段表选项卡(图3)。如果这个选项卡可用,点击错误选项卡以查看错误。如果没有错误选项卡,软件没有任何错误的特定标记样本。如果存在错误4501,请继续阅读。

图3。数据上下文错误选项卡

对总RNA化验,2100专家软件算法分析了不同地区的electropherogram计算RIN (图4)。软件也寻找异常:特征不典型的样本类型。当超过临界异常阈值,RIN不会计算错误4501将会出现在错误选项卡。这些异常阈值时阻止RIN的计算可能不准确。然而,它可能会增加异常阈值计算RIN迫使软件。关于RIN的更多信息可以在这找到应用注释。请注意:RIN NA是一个警告,RIN特定样本可能不可靠(如由于不寻常的噪音/信号,核糖体比率,和其他因素)。清理关键错误消息可能产生RIN,但是安捷伦并不能保证这个值的准确性。雷竞技raybet还建议执行目视检查的数据。一般来说,建议纠正RIN错误只有在芯片运行在技术上是好的和不寻常的特性,例如一个意想不到的高峰,清晰可辨。RIN值本身不能被编辑。

图4。Electropherogram详细区域表明RNA质量。

旁边的描述错误应该表明异常阈值需要增加。在选点explorer中,点击当地的修改当前样本或定位点全球修改芯片上的所有样品的定位点。然后选择先进的从下拉列表中。在RNA数量完整部分,识别异常阈值对应于您希望覆盖的错误。预定义的异常阈值增加到一个(图5)。一个是最轻松的价值。RIN现在将显示在结果选项卡,后跟一个注意:异常阈值(s)手动调整。

图5。如何编辑RIN异常阈值