Masshunter基于定性分析中确定化合物的定量分析方法

嗨TobiasEngl我感动你的问题的质谱分析软件论坛更好的可见性。谢谢!

谢谢你克里斯汀!

对PCDL经理我不确定,但是如果你想使用库编辑器来创建一个自定义库很容易添加单独的光谱。

在我的电脑打开库编辑器(路径是:“C: \ Program Files \安捷伦\ MassHunter \工作站雷竞技raybet\量化\ bin \ LibraryEdit.exe”),然后创建一个新库,或者如果你有mslibrary在文件格式之一。xml,开放图书馆。

添加一个新化合物并填写尽可能充分的细节。一旦复合数据已经添加,单击“新谱”按钮,单击“属性”按钮在频谱视图窗格中。

打开你的试验数据集成和数据文件提取光谱峰值。就我个人而言,我更喜欢简单地运行工作流和处理方法。

在这个步骤中,您可以:

• 右键单击确定光谱和使用“发送光谱PCDL”
• 右键单击光谱质谱结果窗格中,单击“导出”然后发送到一个分隔文件手动操纵
• 选择光谱然后去“MS谱峰列表1”窗格中,列设置为“m / z”和“Abund”,选择所有行(点击第一行,按住“转变”然后单击最后一行),右击,要么使用“出口”或“复制到剪贴板”。

无论选择出口或复制到剪贴板,您将需要在电子表格应用程序中打开操作。你需要的m / z第一列和第二列丰度值。如果使用Excel,使用“文本导入向导”所以你复制数据分成单独的列。

只复制线和数值(排除标题行),然后去图书馆编辑器。您已经创建了化合物,添加一个空白频谱,打开属性窗口。的第一行属性是“丰度值”,点击这条线,然后用省略号按钮点出现在右边。这将打开第二个窗口标题为“谱”几个按钮,点击一个标签“粘贴表”,然后单击“OK”。填写任何你认为合适的数据(至少要包括获得保留时间、来源、样本和ID)。

重复添加复合的过程和为每个所需的化合物的光谱。保存库和量化。

定量:

创建新方法获得扫描数据与图书馆搜索。

在图书馆的方法中,使用新创建的库,只有您感兴趣的化合物为主。选择一组样本数量的限定符。为建立一个定量方法进行正常。

这个过程看起来过于复杂文本格式的,不过很容易和快速完成。

最好的运气!

你好TobiasEngl,

虽然启动量化并启动调版的量化,它似乎使女士一个有效的扫描方法。在有限的测试我能够拯救这个方法,定量,启动量化女士,创建一个新的批处理,然后保存的方法适用于批处理。但这只会让两个限定符/目标。对于一些低质量的化合物与简单的光谱,它可能只分配一个限定符。我不知道有任何方式改变的数量限定符使用此选项或从方法创造使用英语文件。

PCDL主要用于准确质量LCMS书商,出口频谱PCDL用于准确质量msm库。

我知道的唯一的方式来指定两个多预选赛时定量方法是使用导出组件特性在未知的分析中,从获得的扫描数据或使用新的方法在定量与图书馆搜索选项。我意识到这两个避免重新找到你已经发现的化合物,但这些对话框允许您指定的数量限定符/目标。

嗨msweber,

带来一个EI谱的另一种方法从定性到图书馆编辑器是右键单击频谱并选择复制到剪贴板。然后在图书馆编辑器可以选择复合,在空白频谱窗格中点击右键,选择粘贴。您可以右键单击并使用滤波器的峰值消除光谱的峰值与丰度很低。只是确保只有一个频谱中选择,否则你将多个光谱粘贴到图书馆。

谢谢msweber&howard_sanford,我会建议!